崇祯元年七月，陕北地区爆发农民大起义。明廷令三边总督杨鹤负责剿匪，杨鹤的主张是"剿抚兼施、以抚为主"。其实这也是读书人掌兵的通病，福建巡抚熊文灿在福建就是这么干的，郑一官就是在这种大前提下从打海盗成为朝廷副将的。

崇祯二年，农民军王左挂、苗美率兵进攻韩城。陕西总督杨鹤手中无将，情急之下，令当时还是参政的洪承畴领兵出战。洪承畴也不负重托，率兵斩杀敌兵三百人，解了韩城之围，顿时名声大噪。这也不能怪当时的人大惊小怪，这个武功废驰多年，尤其是还是个读书人能够如此很是不易。

崇祯三年)六月，洪承畴被任为延绥巡抚。王左挂降而复叛，被洪承畴诛杀。作为杨鹤手下干将，本该支持上司的招抚政策，可是洪承畴反而大力剿匪。而且不仅剿匪，且并杀降。当时被其杀掉的投降流寇多达数万。很多读书人可能觉得洪承畴滥杀无辜，毛钰却不以为然，一来官府没有那么多的银子和粮食安置，二来这些人一旦放回去还会重新造反，因为辛苦种田哪有劫掠来的爽快。这已经不是单纯的教化问题，而是世界观的问题。

其实如果读过明末"贼军"史就不难发现，李自成、张献忠曾多次诈降，养精蓄锐一段时间后再反。明朝多次对"贼军"剿而不死，就是因为这种诈降。由此可见，洪承畴在这方面是颇有先见之明的。明廷无力养活大批饥民，已就抚者，纷纷再起。不久与总兵杜文焕击败张献忠于清涧县。

崇祯四年，三边总督杨鹤为此被罢官入狱，洪承畴继任陕西三边总督。洪承畴改杨鹤的"边剿边抚(诱降)"为"全力清剿"、"以剿坚抚，先剿后抚"方针，集中兵力进攻陕西农民军。

崇祯五年春，一股农民军由于顶不住官军的压力，向庆阳突围。洪承畴亲赴庆阳，指挥会战，与总兵曹文诏、贺虎臣一起围剿农民军。双方在西澳激战数十次，农民军损失惨重，首领可天飞被斩杀，部将白广恩投降。曹文诏又剿贼于耀州锥子山，贼兵杀独行狼等后投降，洪承畴命令屠杀四百人，剩下的皆遣散。

毛钰日粗关心洪承畴，是在看他什么时候被抽调离开陕西，然后农民军一发不可收拾，席卷山西、陕西、河南等地。这是蛀空大明这个大厦的关键所在。也是毛钰尽快实现移民百万提供了一种可能，无论是起义军还是被起义军祸害的灾民只要到了毛钰手里统统塞到台湾就是了了。

所以回到舟山之后，毛钰就调整了舟山造船厂和南日岛造船厂的生产结构，未来的两年内将会以生产内河运输为主的平底桨帆船为主。当然船只的排水量也是以二号福船为蓝本。兼顾载人和载货。船桨采用齿轮驱动脚踏。这样一来载重和速度都会超越一般的二号福船。

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